A partir de un amplio proceso de concertación liderado por el Ministerio de Relaciones Exteriores que contó con la participación de diversas organizaciones nacionales que agrupan a las víctimas y a los familiares y amigos de las víctimas de la invasión militar de los Estados Unidos de América a la República de Panamá del 20 de diciembre de 1989, el Presidente Juan Carlos Varela, con la participación de la Vicepresidenta y Ministra de Relaciones Exteriores Isabel Saint Malo de Alvarado, expide el Decreto Ejecutivo 121 de 2016 que crea la Comisión 20 de diciembre de 1989, en adelante la Comisión. En ese momento, integrada por cinco panameños: Juan Planells, quien la preside, Maribel Jaén, Enrique Illueca, Svetlana Jaramillo y Rolando Murgas.
El Presidente de la República Laurentino Cortizo Cohen, a través del Decreto Ejecutivo N° 93, del 13 de diciembre de 2022, y en consecuencia al deceso del Ing. Juan Planells Fernández, Comisionado Presidente, nombra la nueva Comisión que tiene la responsabilidad de llevar las riendas de la Comisión. Ellos son Rolando Murgas Torraza, quien la presidirá, acompañado de Manuel Orestes Nieto, Luis Navas Pájaro, Svetlana Inés Jaramillo Donius, Alma Montenegro de Fletcher y Eusebio Muñoz Jiménez.
En la actualidad la Comisión 20 de diciembre de 1989, cuenta con un plazo hasta el 27 de enero de 2027, según el Decreto Ejecutivo N°45 de 24 de junio de 2024, para el cumplimiento de las funciones.